針對COD為40000mg/L的甲硫基乙醛肟廢水，處理這類高濃度、難降解、有毒有害的工業廢水需要采用綜合技術方案。以下是幾種可能的處理方法：

1.預處理：預處理是降低廢水中有機物濃度和毒性的重要步驟，為后續處理提供條件。

1.1物理法

吸附法：使用活性炭、大孔樹脂等吸附劑去除廢水中的有機物。

沉淀法：通過加入化學絮凝劑如聚合氯化鋁(PAC)、聚合硫酸鐵(PFS)等，使廢水中的懸浮物和部分有機物沉淀。

1.2化學法

高級氧化法(AOPs)：利用臭氧、過氧化氫和紫外線等產生自由基，氧化分解難降解有機物。

Fenton法：使用Fe2?和H?O?產生強氧化性的羥基自由基，降解有機物。

2.生物處理

由于甲硫基乙醛肟廢水的可生化性差，直接進行生物處理效果不佳，通常需要先進行預處理提高其可生化性。

2.1水解酸化：通過水解酸化提高廢水的BOD/COD比，使廢水中的難降解有機物轉化為易降解的有機物，為后續的好氧生物處理提供條件。

2.2厭氧生物處理

UASB：上流式厭氧污泥床反應器，適用于高濃度有機廢水的厭氧處理。

CSTR：完全混合式厭氧反應器，適用于處理含固體懸浮物較多的廢水。

2.3好氧生物處理

SBR：序批式活性污泥法，適用于處理高濃度有機廢水。

MBR：膜生物反應器，通過膜分離技術提高污泥濃度，增強處理效率。

3.深度處理

深度處理用于進一步去除預處理和生物處理后的殘余污染物。

3.1催化濕式氧化(CWAO)：在高溫高壓和催化劑存在的條件下，通過氧氣氧化分解有機物，適用于處理高濃度、難降解的有機廢水。

3.2膜分離技術

RO：反滲透技術，用于去除廢水中的溶解性污染物。

NF：納濾技術，用于去除特定分子大小的有機物。

4.綜合處理技術

實際應用中，往往需要將上述方法組合使用，以達到更佳的處理效果。

WAOCWAO工藝：根據研究，采用濕式氧化(WAO)催化濕式氧化(CWAO)工藝處理甲硫基乙醛肟生產廢水，可以取得較高的COD去除率和有機硫轉化率。

綜上所述，處理COD高達40000mg/L的甲硫基乙醛肟廢水需要綜合考慮物理、化學和生物方法，可能還需要結合現場實際情況進行工藝優化和調整。